日本機械学会バイオエンジニアリング部門 メーリングリスト登録者 各位 バイオエンジニアリング部門広報委員、 名古屋工業大学 松井翼と申します。 講習会"遺伝子ネットワーク並列解析プログラム「BENIGN」講習会"開催の 案内が届きましたので、代理送信いたします。 −−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−− 「遺伝子ネットワーク並列解析プログラム「BENIGN」講習会」 【要旨】 遺伝子ネットワーク並列解析プログラムBENIGNの講習会とSCLS計算機システム (京互換機)を用いた実習を開催します。BENIGNは、複数の細胞組織や実験条件 下で採取された遺伝子の発現データから、各条件下での遺伝子間の発現の依存 関係を表すネットワークをベイジアンネットワークにより推定するソフトウェア です。条件ごとに得られたネットワークを相互に比較することで、例えば、時間 とともに動的に変化する遺伝子間の依存関係や、細胞組織ごとの遺伝子の働きの 違いなどを推定して可視化することができます。 講習会では、BENIGNのしくみと利用方法を説明し、BENIGNを用いた遺伝子ネット ワーク解析の実習を行います。 【主催】 HPCI戦略プログラム 分野1「予測する生命科学・医療および創薬基盤」 【共催】 HPCI戦略プログラム 分野1 「予測する生命科学・医療および創薬基盤」 人材養成プログラム(国立研究開発法人産業技術総合研究所 創薬基盤研究部門) 特定非営利活動法人バイオグリッドセンター関西 公益財団法人都市活力研究所 【後援】 国立研究開発法人理化学研究所 情報基盤センター バイオスーパーコンピューティング研究会 【日時】 2015年9月29日(火)13:00 〜 16:00(予定)(12:30 より受付開始) 【場所】 都市活力研究所 セミナー室 グランフロント大阪 北館 タワーC 7階 (大阪市北区大深町3-1) アクセス http://urban-ii.or.jp/about.php#ancer06 【参加費】 無料 【定員】 10名 【申し込み締め切り】 2015年9月11日(金) ただし先着順でお申し込みを受け付けますので、定員になり次第受付を終了 いたします。 【参加申し込み】 下記の項目をご記載のうえ、scls-mado@riken.jp 宛にメールでお申し込み 下さい。 ・氏名 ・所属(会社名、学校名等) ・部署名・学部学科名等(詳細をご記載ください) ・住所 ・電話番号 ・職種 ・年齢 (10歳代、20歳代、30歳代、40歳代、50歳代、60歳代、70歳代、80歳代) ・ご自身のバックグラウンド ・Linux/Unix利用経験 (ほとんど使ったことが無い、たまに使う程度、頻繁に 使っている) ・並列計算機やスーパーコンピュータの使用経験: (あり、なし) ・受講動機 (できるだけ詳しく教えて下さい) ・この講習に期待することやご希望等あれば教えて下さい ※本プログラムは文部科学省支援の下、理化学研究所によって実施・委託されて おり、アンケートおよび事後追跡調査等へのご協力をお願いすることがあります。 受講者には事務局から事前準備についてお知らせしますので、指示に従って ご準備をお願いいたします。 (注)SCLS計算機システム利用アカウント申請にあたっては、下記URLのSCLS 計算機システム利用公募の「応募資格」を満たしていることが条件となります。 http://www.scls.riken.jp/supercomputer/public.html#mokuji4 実習は、受講者が各自持参するノートPC からSCLS計算機システムにリモート ログインして行いますので、受講者には事前にSSH鍵ペアのご準備をお願いいた します。またSCLS利用アカウントの申請手続きも別途必要です。(実習用PCは 無線LAN必須、最新のウイルスチェッカーがインストールされているものをご持参 ください。) 【問い合わせ先】 国立研究開発法人理化学研究所 HPCI計算生命科学推進プログラム scls-mado@riken.jp −−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−−− 以上、よろしくお願い致します。 <代理送信> ------------------------------------------------------------ 松井 翼 (Tsubasa S. Matsui) 特任助教 名古屋工業大学共同ナノメディシン科学専攻 出口真次研究室(おもひ領域) 〒466-8555 名古屋市昭和区御器所町 名古屋工業大学3号館502室 E-mail: ts.mat29@nitech.ac.jp Phone: 052-735-5178 ------------------------------------------------------------