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原子間の相互作用を表すポテンシャルエネルギー．材料の特性を支配する関係式であり，原子の種類・組合せによって異なる．簡単な経験的ポテンシャルから量子力学に基づく非経験的方法によって評価されたものまで多数のポテンシャルが提案されており，シミュレーションの成否はその質に大きく依存する．また，分子動力学法において，原子に作用する力は原子間ポテンシャルのその原子の位置に対する微分より評価される．
